Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC38A2Q96QD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC38A2Q96QD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC38A2Q96QD8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A2Q96QD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A2Q96QD8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms