Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXN4Q96NZ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXN4Q96NZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN4Q96NZ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN4Q96NZ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXN4Q96NZ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXN4Q96NZ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms