Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC115Q96NT0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC115Q96NT0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC115Q96NT0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC115Q96NT0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC115Q96NT0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC115Q96NT0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms