Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRFN5Q96NI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRFN5Q96NI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN5Q96NI6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN5Q96NI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN5Q96NI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN5Q96NI6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms