Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE2Q96MF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMCE2Q96MF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMCE2Q96MF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE2Q96MF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE2Q96MF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE2Q96MF7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE2Q96MF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms