Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EP400Q96L91 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
EP400Q96L91 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
EP400Q96L91 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
EP400Q96L91 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
EP400Q96L91 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EP400Q96L91 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EP400Q96L91 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EP400Q96L91 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EP400Q96L91 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
EP400Q96L91 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
EP400Q96L91 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EP400Q96L91 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
EP400Q96L91 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms