Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM8Q96KF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM8Q96KF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMIM8Q96KF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM8Q96KF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM8Q96KF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms