Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
LRRIQ1Q96JM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
LRRIQ1Q96JM4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRIQ1Q96JM4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRIQ1Q96JM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.21
LRRIQ1Q96JM4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRIQ1Q96JM4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
LRRIQ1Q96JM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms