Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VSIG2Q96IQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VSIG2Q96IQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VSIG2Q96IQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VSIG2Q96IQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VSIG2Q96IQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSIG2Q96IQ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VSIG2Q96IQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VSIG2Q96IQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VSIG2Q96IQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms