Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL48Q96GC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL48Q96GC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL48Q96GC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL48Q96GC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL48Q96GC5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms