Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP6Q96FZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP6Q96FZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHMP6Q96FZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHMP6Q96FZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP6Q96FZ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms