Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MVB12AQ96EY5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MVB12AQ96EY5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MVB12AQ96EY5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MVB12AQ96EY5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MVB12AQ96EY5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MVB12AQ96EY5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms