Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC51Q96ER9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC51Q96ER9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC51Q96ER9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC51Q96ER9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC51Q96ER9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms