Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHFRQ96EP1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHFRQ96EP1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHFRQ96EP1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHFRQ96EP1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHFRQ96EP1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHFRQ96EP1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHFRQ96EP1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHFRQ96EP1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHFRQ96EP1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHFRQ96EP1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHFRQ96EP1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms