Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF31Q96EP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF31Q96EP0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF31Q96EP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF31Q96EP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF31Q96EP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF31Q96EP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF31Q96EP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms