Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MRRFQ96E11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRRFQ96E11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRRFQ96E11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRRFQ96E11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRRFQ96E11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRRFQ96E11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRRFQ96E11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms