Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCN3Q96D15 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCN3Q96D15 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCN3Q96D15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCN3Q96D15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCN3Q96D15 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms