Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAMM41Q96BW9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAMM41Q96BW9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAMM41Q96BW9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAMM41Q96BW9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAMM41Q96BW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.6 ms