Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VOPP1Q96AW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VOPP1Q96AW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VOPP1Q96AW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VOPP1Q96AW1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VOPP1Q96AW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VOPP1Q96AW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VOPP1Q96AW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VOPP1Q96AW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VOPP1Q96AW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms