Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC17Q96AE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC17Q96AE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC17Q96AE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTC17Q96AE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms