Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRUQ92729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRUQ92729 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRUQ92729 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRUQ92729 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRUQ92729 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRUQ92729 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPRUQ92729 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRUQ92729 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPRUQ92729 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
PTPRUQ92729 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRUQ92729 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRUQ92729 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms