Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABGGTAQ92696 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RABGGTAQ92696 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RABGGTAQ92696 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTAQ92696 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABGGTAQ92696 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTAQ92696 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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