Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN4Q92575 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN4Q92575 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UBXN4Q92575 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBXN4Q92575 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN4Q92575 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN4Q92575 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms