Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3S1Q92572 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3S1Q92572 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3S1Q92572 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3S1Q92572 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP3S1Q92572 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP3S1Q92572 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms