Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAPGEF5Q92565 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAPGEF5Q92565 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAPGEF5Q92565 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAPGEF5Q92565 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAPGEF5Q92565 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms