Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SOCS4Q8WXH5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SOCS4Q8WXH5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SOCS4Q8WXH5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SOCS4Q8WXH5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SOCS4Q8WXH5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SOCS4Q8WXH5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOCS4Q8WXH5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms