Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASKIN2Q8WXE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASKIN2Q8WXE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASKIN2Q8WXE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASKIN2Q8WXE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASKIN2Q8WXE0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASKIN2Q8WXE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASKIN2Q8WXE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms