Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1Q8WVP7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBR1Q8WVP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1Q8WVP7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBR1Q8WVP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMBR1Q8WVP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMBR1Q8WVP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms