Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG1Q8WTW3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG1Q8WTW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.58■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG1Q8WTW3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG1Q8WTW3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG1Q8WTW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG1Q8WTW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms