Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TMC1Q8TDI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TMC1Q8TDI8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TMC1Q8TDI8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TMC1Q8TDI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMC1Q8TDI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TMC1Q8TDI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TMC1Q8TDI8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMC1Q8TDI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TMC1Q8TDI8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMC1Q8TDI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms