Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCFD2Q8NI22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCFD2Q8NI22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCFD2Q8NI22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCFD2Q8NI22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCFD2Q8NI22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCFD2Q8NI22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms