Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL4L1Q8NHW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL4L1Q8NHW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL4L1Q8NHW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL4L1Q8NHW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL4L1Q8NHW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL4L1Q8NHW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms