Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP61Q8NHU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP61Q8NHU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP61Q8NHU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP61Q8NHU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms