Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBEAQ8NFP9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBEAQ8NFP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBEAQ8NFP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBEAQ8NFP9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBEAQ8NFP9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBEAQ8NFP9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms