Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNNM3Q8NE01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNNM3Q8NE01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNNM3Q8NE01 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNNM3Q8NE01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNNM3Q8NE01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms