Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KDM1BQ8NB78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KDM1BQ8NB78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM1BQ8NB78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM1BQ8NB78 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM1BQ8NB78 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM1BQ8NB78 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms