Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG16L2Q8NAA4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L2Q8NAA4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG16L2Q8NAA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L2Q8NAA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L2Q8NAA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms