Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC155Q8N6L0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC155Q8N6L0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC155Q8N6L0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC155Q8N6L0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC155Q8N6L0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC155Q8N6L0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms