Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PHTF2Q8N3S3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHTF2Q8N3S3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHTF2Q8N3S3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHTF2Q8N3S3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHTF2Q8N3S3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHTF2Q8N3S3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms