Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARP8Q8N3A8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP8Q8N3A8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP8Q8N3A8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP8Q8N3A8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PARP8Q8N3A8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP8Q8N3A8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP8Q8N3A8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP8Q8N3A8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP8Q8N3A8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP8Q8N3A8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms