Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC25Q8N386 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC25Q8N386 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC25Q8N386 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC25Q8N386 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC25Q8N386 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC25Q8N386 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC25Q8N386 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC25Q8N386 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC25Q8N386 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC25Q8N386 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms