Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHISA5Q8N114 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA5Q8N114 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA5Q8N114 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA5Q8N114 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA5Q8N114 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms