Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ8

SUGP1, SURP and G-patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGP1Q8IWZ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUGP1Q8IWZ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUGP1Q8IWZ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUGP1Q8IWZ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUGP1Q8IWZ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUGP1Q8IWZ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms