Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SFTPA1Q8IWL2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFTPA1Q8IWL2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFTPA1Q8IWL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFTPA1Q8IWL2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFTPA1Q8IWL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFTPA1Q8IWL2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFTPA1Q8IWL2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms