Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIX1LQ8IVB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIX1LQ8IVB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIX1LQ8IVB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIX1LQ8IVB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIX1LQ8IVB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms