Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERI1Q8IV48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERI1Q8IV48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERI1Q8IV48 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERI1Q8IV48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERI1Q8IV48 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI1Q8IV48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI1Q8IV48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI1Q8IV48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI1Q8IV48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI1Q8IV48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI1Q8IV48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms