Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR5

TMTC1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC1Q8IUR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMTC1Q8IUR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms