Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR5

TMTC1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC1Q8IUR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC1Q8IUR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC1Q8IUR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC1Q8IUR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMTC1Q8IUR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMTC1Q8IUR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMTC1Q8IUR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMTC1Q8IUR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMTC1Q8IUR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms