Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUH4

ZDHHC13, Palmitoyltransferase ZDHHC13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC13Q8IUH4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZDHHC13Q8IUH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC13Q8IUH4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC13Q8IUH4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC13Q8IUH4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC13Q8IUH4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC13Q8IUH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms