Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NME9Q86XW9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NME9Q86XW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NME9Q86XW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NME9Q86XW9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NME9Q86XW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NME9Q86XW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NME9Q86XW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NME9Q86XW9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NME9Q86XW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NME9Q86XW9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NME9Q86XW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms