Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHFR2Q86XF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHFR2Q86XF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DHFR2Q86XF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHFR2Q86XF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHFR2Q86XF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHFR2Q86XF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms